В трагический день 22 ноября 1963 года, когда в Далласе застрелили президента Кеннеди, леди Бёрд сидела в автомобиле, следовавшем за президентом, на заднем сидении, между мужем и демократическим сенатором Ральфом В. Ярбоуф из Техаса. Когда раздались выстрелы, кто-то из охраны крикнул: «Все вниз!», и леди Бёрд пригнулась. Вдруг автомобиль стал набирать скорость, а когда остановился и она подняла голову, то увидела, что они стоят перед госпиталем Парклэнд-Мемориал. Сенатор Ярбоуф воскликнул: «О Боже! Президента убили!» Леди Бёрд была в крайней растерянности.
Позже она вспоминала: «В этот трагичный момент я хотела быть возле миссис Кеннеди и увидела ее в полном одиночестве, в холле, у двери в операционный зал, где, по всей видимости, лежал президент. Никогда в моей жизни мне так не хотелось утешить кого-либо и никогда еще я не чувствовала себя такой беспомощной…»
22 ноября 1963 года, при довольно необычных обстоятельствах, был приведен к присяге 36-й президент Соединенных Штатов, Линдон Б. Джонсон. Леди Бёрд помогала мужу составить речь для инаугурации, и сама сделала заявление.
Леди Бёрд изо всех сил старалась облегчить семье Кеннеди эти трудные дни. Джонсоны предложили вдове президента оставаться в Белом доме столько, сколько она сама захочет.
В Белый дом они переехали в декабре 1963 года. «Я чувствую себя так, как будто вдруг оказалась на сцене и должна играть роль, к которой не совсем готова», — сказала леди Бёрд. Вначале она осмотрела все 132 помещения резиденции. «Самая главная задача состоит в том, чтобы в Белом доме было удобное место для продуктивной работы Линдона», — заметила она. Главного куратора Белого дома попросила оставаться на своем посту и дала ему соответствующие инструкции: «Самое важное лицо — это мой муж, за ним следуют мои дочери и в заключение — я». Вскоре она стала принимать активное участие в управлении Белым домом. Дж. Б. Уэст, главный куратор, выразил даже мнение, что она ведет себя «как шеф какого-нибудь большого предприятия». В то время обслуживающий персонал Белого дома насчитывал 74 человека.
О новой Первой леди «Нью-Йорк Таймс» писала, что миссис Джонсон «самая политизированная женщина, которая находилась в Белом доме со времен Элеоноры Рузвельт».
Как и ее предшественница, леди Бёрд организовывала фестивали искусств, приглашала писателей и артистов в Белый дом, даже зная, что в этом отношении она не смогла бы достигнуть уровня Жаклин Кеннеди.
За пять лет президентства Джонсона в Белый дом было приглашено более 200 000 гостей. Леди Бёрд присматривала за всеми официальными обедами и ужинами, приемами и другими мероприятиями и умело импровизировала, если Джонсон снова заставал ее врасплох с неожиданными гостями.
Джонсоны любили танцевать, поэтому в Белом доме теперь чаще играл оркестр. Леди Бёрд даже как-то заметила: «Смешно, теперь, когда нам уже за пятьдесят, мы чаще танцуем, чем когда-либо прежде в нашей жизни».
Когда Джонсоны переехали в Белый дом, их дочери Люси и Линда, как все девушки, ходили на свидания. И мать постоянно напоминала им о необходимости надеть теплую рубашку, обычно добавляя: «Не забудьте взять с собой охрану».
Большим событием в хронике высшего общества Вашингтона стали свадьбы дочерей президента. 6 августа 1966 года Люси Бейнес вступила в брак с Патриком Ньюгентом, а 9 декабря 1967 года Линда Бёрд вышла замуж за капитана морской пехоты Чарльза С. Рабба, который впоследствии стал губернатором штата Виргиния. Линда Бёрд была седьмой дочерью президента Соединенных Штатов, которая выходила замуж в Белом доме.
Когда Джонсона спросили однажды, почему члены его семьи пользуются одной и той же монограммой — а именно, «ЛБД» (LBJ) — он ответил: «В целях экономии. Таким образом мы можем пользоваться одними и теми же чемоданами».
Леди Бёрд не избегала средств массовой информации, она часто давала интервью и высказывалась в адрес прессы. Ее излюбленными темами в беседах с журналистами были преступность, женские вопросы и проблемы бедности.
За пять лет пребывания в Белом доме леди Бёрд приняла участие в 718 мероприятиях и произнесла 164 речи. Подсчитали, что 75 % времени она затратила на выполнение различных общественных обязанностей. Вначале она была плохим оратором, и перед каждым выступлением ее охватывало лихорадочное волнение, поэтому она стала брать уроки риторики. Речи ей писали сотрудники, и прежде всего пресс-секретарь Лиз Карпентер. Так как леди Бёрд не давала пресс-конференций, Лиз лично встречалась с журналистами, информировала их об активной деятельности Первой леди и передавала ее мнение по актуальным политическим вопросам.
Леди Бёрд писала статьи о неравноправии женщин, и когда Джонсон приходил домой, она часто встречала его словами: «Что ты сегодня сделал для женщин?» Она даже предлагала ему пригласить на различные должности в его администрации побольше женщин.
18 января 1968 года разгорелся жаркий спор между леди Бёрд и известной цветной певицей Этой Китт, который нашел различные отклики в прессе. В этот день леди Бёрд пригласила несколько десятков женщин, активно участвующих в общественной жизни, для дискуссии. Перед этим они были уже «проверены» ФБР и выдержали испытание. На обеде перед дискуссией присутствовал президент Джонсон, который поговорил с собравшимися и покинул зал. В ходе обсуждения зашла речь о проблемах американской молодежи. Слово взяла Эта Китт: «Молодежь недовольна, потому что родители недовольны». Далее она высказала мнение, что молодежь возмущается прежде всего тем, что все еще продолжается война во Вьетнаме, и в заключение она высказала некоторые критические замечания по поводу этой войны.