Во время первой мировой войны Элеонора помогала в работе Красного Креста, шила одежду для солдат, работала в солдатской столовой, хотя до конца жизни так и осталась неважным кулинаром. Единственным блюдом, которое ей удавалось, была яичница, поэтому она часто предлагала ее гостям. Кроме того, она полностью отвергала спиртные напитки.
В 1918 году из путешествия по Европе Франклин вернулся с воспалением легких. Элеонора заботилась о больном муже и просматривала его корреспонденцию. Именно тогда ей в руки попало письмо, из которого следовало, что ее муж поддерживал интимные отношения с некой Люси Пейдж Мэсер, молодой, красивой женщиной, которая с 1914 года была его секретаршей. Это открытие едва не разрушило их брак. Много лет спустя Элеонора доверительно поведала друзьям: «Для меня тогда рухнул весь мир». Вначале она предложила мужу развод, но потом они пришли к заключению, что, учитывая интересы детей и его политическую карьеру, такое решение было бы неразумным. Франклин обещал порвать с Люси, а Элеонора простила ему нарушение супружеской верности, но уволила Люси, которая вскоре поступила на военную службу. В 1920 она вышла замуж. Много лет спустя Рузвельт возобновил отношения с уже овдовевшей Люси. В день его смерти, 12 апреля 1945 года, она была у него в Уорм-Спрингс. Письменно Элеонора никогда не высказывалась об этом, но друзьям сказала: «Я могу простить, но не забыть».
Этот роман оставил глубокий след в супружеской жизни Рузвельтов, прежняя теплота отношений и доверие никогда не вернулись. Элеонора продолжала заботиться о муже, но всегда сохраняла определенную дистанцию по отношению к нему и свекрови. Она жила своими интересами и демонстрировала независимость. Биографы единодушно утверждают, что с этого времени они спали в разных спальнях.
В начале 1919 года Элеонора, сопровождая мужа во время поездки в Англию и Францию, стала свидетельницей Версальской мирной конференции. В Вашингтоне продолжала поддерживать раненых ветеранов войны, посещала их в госпиталях, приносила подарки, подбадривала.
Она активно занималась проблемами американских женщин, особенно условиями работы на промышленных предприятиях. На военную службу уходило все больше и больше мужчин, а на предприятиях возрастало количество работающих женщин, поэтому в октябре 1919 года Элеонора приняла участие в Международном конгрессе работниц.
В 1920 году Рузвельт был выдвинут на пост вице-президента от демократической партии. Элеонора участвовала в предвыборной кампании, помогая подготовить речи и публично поддерживала Лигу Наций, против которой ожесточенно боролись республиканцы. Проводила большую кампанию по привлечению американских женщин к выборам. Научилась машинописи и стенографии.
Демократы проиграли на выборах 1920 года, Элеонора вернулась с мужем в Нью-Йорк.
В августе 1921 года 39-летний Франклин Рузвельт заболел полиомиелитом. Его мать настаивала на том, чтобы он отошел от общественной жизни, но Элеонора энергично возражала. Подбадриваемый женой, он начал бороться с болезнью. Любое достижение воспринимал как важную победу, хотя до конца жизни мог передвигаться только в коляске. Много лет спустя Элеонора вспоминала, что «болезнь мужа окончательно заставила меня стать на собственные ноги. Его болезнь оставила отпечаток на моем отношении к его, моей жизни и жизни наших детей». Ту зиму 1921–22 годов она считала «самым тяжелым испытанием в жизни».
Рузвельт решил продолжать политическую карьеру, Элеонора активно помогала ему в этом. Она приглашала политиков в резиденцию Рузвельта, выступала с докладами, собирала деньги для предвыборной кампании демократов, даже получила водительские права, хотя никогда не считалась хорошим водителем. Одна из ее многочисленных опубликованных статей этого периода называлась «Почему я стала демократом?». В ней она выступает не только от собственного имени, но и от имени мужа: «Демократическая партия больше заботится о благосостоянии и интересах общества, чем об интересах крупных капиталистов». Вначале она уверяла мужа, что будет активно работать, пока он не восстановит силы, но вскоре заявила, что политическая деятельность приносит ей моральное удовлетворение.
Элеонора считала себя плохим оратором. Искусству публичных выступлений ее научил друг дома, Луис Мак-Генри Гау, редактор «Нью-Йорк Геральд». После этих уроков она приобрела уверенность.
На съезде демократической партии 1924 года Элеонора Рузвельт говорила о тех вопросах предвыборной программы, которые требовали равноправия женщин. Для кандидата от демократов на пост президента, Ал. Смита, Франклин Рузвельт организовал предвыборную кампанию в штате Нью-Йорк.
Элеонора занималась и экономическими вопросами, что для того времени было не совсем обычно. Вместе с подругами она купила в Нью-Йорке школу для девочек, была там заместителем директора и преподавала историю. Кроме того, открыла мебельную фабрику, куда принимались безработные из сельских регионов.
В 1928 году Франклин Делано Рузвельт стал губернатором штата Нью-Йорк. Для Элеоноры это означало дополнительные обязанности. Как супруга губернатора она посещала тюрьмы, больницы и другие общественные заведения и рассказывала мужу об их работе. Мнения их не всегда совпадали. Главные разногласия вызвал сухой закон, который Элеонора хотела сохранить. Она не разделяла критическое отношение мужа к Лиге Наций, но в подавляющем большинстве обсуждаемых вопросов их мнения совпадали. Когда в 1932 году демократическая партия выставила кандидатуру Франклина Рузвельта на пост президента, Элеонора поначалу сдерживала эмоции, но во время предвыборной борьбы помогала мужу, собирая необходимые материалы для его речей. Появлялась вместе с ним на собраниях, работала в отделе женщин от демократической партии. В честь победы Франклина Делано Рузвельта над Гувером в ночь выборов даже выпила немного шампанского.